以上長期隨訪時間的建議主要基于基因zhiliao的產品類型,具體產品的隨訪時間取決于產品的特性和體內存在時間、轉基因表達時間、遲發性不良反應的預期時間及發生率、受試者適應癥和預期生存期、給藥途徑、以及長期隨訪的其他觀察目的。隨著隨訪數據的積累,研究者和研究申辦方可能會根據產品的存在情況、轉基因表達和臨床表現的持續評估情況,延長或縮短長期隨訪的持續時間。如果研究申辦方認為其基因zhiliao產品安全性風險較低、無需開展長期隨訪臨床研究,或者希望變更隨訪時間,應合理說明依據或變更理由并與藥品監督管理部門進行溝通。如何檢測是否發生脫靶? 基因編輯的脫靶率檢測一般有兩種方法。臺州crispr/cas9脫靶檢測評估標準
BLESS:利用生物素標簽對DSBs進行原位標記,后經PCR擴增實現對于生物素標記片段的富集,并通過二代測序實現脫靶位點檢測。直接檢測細胞中的切割位點,靈敏度與細胞、組織密切相關。LAM-HTGTS,片段化的gDNA經過LAM-PCR引入接頭,然后進行全基因組易位測序。高通量的全基因組范圍檢測,可準確檢測DSBs引發的重排。GUIDE-Seq,將dsODN s標簽整合到DSBs位點,通過二代測序檢測這些標簽所在的基因組區域,從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細胞內檢測方法。能檢測低頻脫靶突變。Digenome-Seq,片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育,進行全基因組測序檢測脫靶。全基因組測序,直接檢測切割位點,能檢測低頻脫靶突變。高精度脫靶檢測政策選擇潛在的脫靶位點,例如選擇gRNA預測網站上Top 5潛在脫靶位點,進行Sanger測序單克隆;
CRISPR/Cas9的問題:和TALEN和ZFNS技術一樣,CRISPR/Cas9技術在應用時也存在一定概率的脫靶問題——Cas9核酸酶在非目標位點發生切割,引入非預期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會直接破壞細胞的基本功能,帶來不可預控的嚴重后果。如何減輕脫靶效應?gRNA的GC含量:gRNA 的序列結構對CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性,因為較高的 GC 含量穩定了DNA:RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結合。gRNA-on-gRNA序列的位置對編輯有影響,位于四個核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥嘌呤優先選擇在gRNA的20位,胞嘧啶優先選擇在16位以增加靶向編輯。
采用基因編輯技術制備的細胞產品。對于采用基因編輯技術制備的基因修飾細胞產品,應進行體外在靶和脫靶活性評估,以確認修飾酶或向導RNA對靶基因序列的特異性。在評估基因編輯的脫靶風險時,應說明所選擇的評價策略的合理性和敏感性。雖然采用計算機分析預測基因編輯的潛在脫靶位點,并對潛在脫靶位點進行深度測序分析,可用于評估基因編輯的脫靶風險;但選擇的評價策略仍應包含體外全基因組測序比對,以證明潛在脫靶位點未出現脫靶。此外,在評估脫靶活性時,還應評估種屬特異性的差異、細胞病理生理狀態的差異或細胞類型的差異對非臨床數據預測性的影響。必要時,還應分析基因編輯對細胞表型和生理功能的潛在影響。高深度全基因組重測序服務,該方法能多方位精細地對基因編輯的細胞或個體進行off-target檢測。
對于基因修飾細胞zhiliao產品,充分的非臨床研究是為了:(1)闡明基因修飾的目的、功能以及產品的作用機制,明確其在擬定患者人群中使用的生物學合理性;(2)為臨床試驗的給藥途徑、給藥程序、給藥劑量的選擇提供支持性依據;(3)根據潛在風險因素,闡明毒性反應特征,預測人體可能出現的不良反應,確定不良反應的臨床監測指標,為制定臨床風險控制措施提供參考依據。因此,應充分開展非臨床研究,收集用于風險獲益評估的信息,以確立擬開發產品在目標患者人群中預期具有合理的、可接受的獲益風險比,同時為臨床試驗的設計和風險控制策略的制定提供支持性依據。脫靶檢測方法,推薦唯可生物,實驗實力強,專業性高,檢測效率高,結果準確率高。常州crispr/cas9脫靶檢測評估標準
基因編輯脫靶檢測,推薦唯可生物,實驗實力強,專業性高,檢測效率高,結果準確率高。臺州crispr/cas9脫靶檢測評估標準
CRISPR/Cas系統是細菌和古細菌在不斷進化的過程中產生的適應性免疫防御機制,它應用CRISPR RNA(crRNA)以堿基互補的形式引導相應的Cas蛋白識別入侵的外源基因組,并對其DNA進行剪切,用以保護自身的基因組免受外源核酸如噬菌體、病毒等的干擾和破壞。經過人為改造后,可在真核細胞中實現高度靈活且特異的基因組編輯,通過設計特異性向導RNA(Single guide RNA, sgRNA)序列與靶序列進行堿基配對,從而引導Cas蛋白結合到靶序列處,行使DNA切割功能,然后利用細胞的非同源性末端連接(Non-homologous end joining, NHEJ)或同源重組(Homologous recombination,HR)修復機制對斷裂的DNA進行插入缺失(Indel)、修復(Repair)或替換(Replacement)。由于其相對于鋅指核酸酶(ZFNs)和轉錄jihuo因子樣效應物核酸酶(TALENs)技術更易于操作,而且更高效,因而被廣運用于對基因組特定位點進行靶向編輯。臺州crispr/cas9脫靶檢測評估標準
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