在細菌細胞中，某種特定基因的數目。一般檢測方法有若是測序結果，可選用censor軟件檢測相關拷貝數。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學方法。其原理是將待測的DNA樣品固定在固相載體（硝酸纖維膜或尼龍膜）上，與標記的核酸探針進行雜交，在與探針有同源序列的固相DNA的位置上顯示出雜交信號，通過檢測信號的有無、強弱可以對樣品定性、定量，從而計算出轉入的拷貝數。Southern法準確性高、特異性強，但存在費時費力的缺點。另外，由于 Southern 法檢測不經過靶片段的擴增（ PCR ），一般每個電泳通道需要 10-30 μ g 的 DNA ，在實際操作中就需要較大量的植物材料來提取 DNA ，而轉基因植物的愈傷組織在無菌條件下經過篩選、重新分化后一般都比較細弱，不宜大量取樣。如果外源基因在插入時發生基因重組，造成限制性酶切位點丟失， Southern 法也無法檢測到。這些因素都制約了 Southern 法在 T 0 代轉基因植物中檢測外源基因拷貝數的應用。唯可生物開發并驗證了一種基于探針的定量聚合酶鏈反應(qPCR)分析方法，用于慢病毒載體拷貝數(VCN)定量。南京CAR-T載體拷貝數技術

qPCR及dPCR定量檢測比較分析,對于所有分析的患者樣本，qPCR和dPCR提供了高度相似、重疊的CAR拷貝數結果。每個患者使用qPCR和dPCR獲得的數據，對于CAR-T細胞擴增水平較低的患者樣本(即UPN#008，#012和#018;比較大CAR-T細胞水平<5000拷貝的PBMCgDNA)，仍存在明顯的統計學相關性(R2>0.78;P<0.05)，證實了即使在低CAR-T細胞水平下qPCR和dPCR的可比性。將dPCR與qPCR結果(qPCR設置為100%)進行個體拷貝數比較時，dPCR的平均定量結果為70+34%，即平均相對差為-30%。實際上，對于幾乎所有測量樣本，使用dPCR測定的拷貝數都較低。這一觀察結果與dPCR(axis-cel或tisa-cel)檢測方法無關。寧波CAR-T載體拷貝數方法慢病毒前病毒拷貝數會影響轉導細胞中轉基因的表達水平。

嵌合抗原受體（Chimericantigenreceptor，CAR）-T細胞（CAR-T）是指通過基因修飾技術，使用病毒等載體將帶有特異性抗原識別結構域、鉸鏈區、跨膜區、共刺激信號jihuo區等遺傳物質轉入自體或異體T細胞形成的。CAR-T回輸到患者體內后，可與腫瘤細胞表面特異性抗原相結合而jihuo，通過釋放穿孔素、顆粒酶等直接殺傷腫瘤細胞達到zhiliaoliu的目的。CAR-T對多種血液liu顯示了較好的臨床效果，對實體瘤zhiliao也表現出了較大的zhiliao潛力。目前已有多個產品經美國、歐盟、中國批準上市，適應癥涉及急性B淋巴細胞白血病、B淋巴細胞瘤、多發性骨髓瘤。

CAR-T細胞輸注后患者反應及毒性分析：本次收集攻擊113例患者，采用qPCR和dPCR檢測20例使用axis-cel和tissa-cel處理的gDNA樣本的拷貝數。在接受tissa-celzhiliao的患者中，9例患者接受了DLBCLzhiliao，1例患者接受了ALLzhiliao。大多數患者為男性，zhiliao患者的中位年齡為56.5歲(范圍10-71歲)，患者之前接受了2-7個zhiliao線。由于血液病或進展性疾病(PD)的高負擔，大多數患者接受了淋巴清理和CAR-T細胞之間的橋接zhiliao。其中4例患者完全緩解(CR,n=2)或部分緩解(PR,n=2)，5例患者病情穩定(SD)，8例患者雖經zhiliao仍有PD。載體拷貝數安評，可咨詢上海唯可生物。

對于CAR修飾的免疫細胞，應采用多種體外方法評估其胞外抗原識別區的脫靶風險。TCR修飾免疫細胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先，應采用體外試驗測定TCR修飾的免疫細胞與人自身抗原肽-HLA（與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同）復合物的親和力，并說明抗原肽的選擇依據及選擇范圍。此外，還應研究其他相關或不相關的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應可能，應確定靶抗原肽的較小識別基序（motif），并采用計算機預測分析評估交叉反應性。如果計算機預測可識別出具有潛在交叉反應性的抗原肽，應在體外測定TCR修飾免疫細胞對表達相應蛋白或遞呈相應抗原肽的的細胞的識別能力。如果不能排除交叉反應性，應基于含有潛在交叉反應性抗原肽的蛋白的表達模式以及TCR與潛在交叉反應性抗原肽的親和力來進行風險評估。為獲得TCR與其他等位HLA潛在交叉反應性的信息，應進行充分的HLA交叉反應性篩選。載體拷貝數就是某種質粒在單個細菌中的數量。南京細胞療法載體拷貝數分析

怎樣增加低拷貝質粒的提取效率？南京CAR-T載體拷貝數技術

質粒的不相容性通俗來說，就是一山不能容二虎。但是作為科學來說，我們需要一個嚴謹的定義。“利用同一復制系統的兩個質粒會在復制和隨后向自細胞的分配過程中彼此競爭，這樣的質粒在細菌培養物中不能和平共處，這種現象稱之為不相容性”。那要怎么才能在一個菌里面使用兩個質粒呢？簡單的方法就是使用不同復制源的且帶有不同抗性基因的兩個質粒。pUCori：復制起始點，pUC為高拷貝表達質粒（120-200個/細胞）。Amp：氨芐抗性，為原核抗性，用于質粒抽提時的篩選。U6promoter：U6啟動子，真核啟動子，啟動shRNA的表達。CMV：真核啟動子，啟動ZsGreen1的表達。ZsGreen1：第三代綠色熒光蛋白，亮度比較高的的熒光蛋白。PGK：真核啟動子，啟動Puro的表達。Puro：嘌呤霉素抗性基因，真核抗性，用于質粒或病毒進入細胞后的篩選。Amp：氨芐抗性基因，原核抗性，用于質粒抽提時的篩選。WPRE：轉錄后調控序列，增加外源片段的表達效率。3’LTR、5LTR：逆轉錄病毒基因組兩端各有一個長末端重復序列(5—LTR和3—LTR)，不編碼蛋白質，含有啟動子，增強子等調控元件。南京CAR-T載體拷貝數技術