ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端處理上的主要不同點如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,它從DNA鏈的3'-OH末端逐步切去單核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一種5'→3'核酸外切酶,能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**底物特異性**:-**ExoIII**:適底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于雙鏈DNA切刻位點產生單鏈缺口。由于對單鏈DNA無活性,因此難以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:適底物是5'磷酸化的雙鏈DNA,對單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低,不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**活性差異**:-**ExoIII**:對具有3'-突出末端(至少有4個堿基,且具有3'-末端C殘基)的DNA、單鏈DNA、硫代磷酸酯連接的核苷酸無活性。-**Lambda核酸外切酶**:對5'-OH端的切割速度比5'-P端慢約20倍;對單鏈DNA的酶切速度比雙鏈DNA慢約100倍。4.**應用場景**:-**ExoIII**:可以用于生產特定方向的單鏈DNA,將線性化DNA設計成為一端為不切割末端(3'突出端),另一端則設計為易切割末端(平端或5'突出端)。
蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MNase)是一種特殊的融合蛋白,它結合了蛋白A和微球菌核酸酶(MNase,MicrococcalNuclease)的特性。以下是pA-MNase的一些關鍵特點和應用:1.**融合表達產物**:pA-MNase是蛋白A與微球菌核酸酶MNase的融合表達產物,因此它同時具有ProteinA的抗體結合活性和MNase的核酸內切酶活性。2.**雙重功能**:由于其雙重功能,pA-MNase常用于蛋白質-DNA相互作用研究,特別是在ChIC(ChromatinImmunocleavage)和CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)技術中。3.**ProteinA的特性**:ProteinA是一種發現于金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的細胞壁表面蛋白,分子量為42kDa,能特異性地與哺乳動物免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)結合,通常結合部位為免疫球蛋白的Fc區。4.**微球菌核酸酶(MNase)的特性**:MNase是一種核酸內切酶,能夠降解核酸,常用于降解蛋白質制備中存在的核酸,減少細胞裂解液的粘度,以及用于染色質結構分析和快速RNA測序。5.**反應條件**:MNase的反應條件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer,需要補充100μg/ml重組白蛋白,分子生物學級,并在37°C下孵化。Recombinant Human PEDF由于其高活性,pA-Tn5轉座酶允許從極少量的細胞中進行實驗,如單細胞水平的研究。
T5核酸外切酶(T5Exonuclease)具有以下特點和技術應用:1.**降解方向**:T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解雙鏈或單鏈DNA。2.**起始消化位置**:T5核酸外切酶既能從單鏈或雙鏈DNA的5'末端起始消化,也可以從線性或環狀雙鏈DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)處起始消化。3.**對超螺旋雙鏈DNA的作用**:T5核酸外切酶無法降解超螺旋雙鏈DNA。4.**單鏈DNA核酸內切酶活性**:T5核酸外切酶還具有單鏈DNA核酸內切酶活性。5.**應用領域**:-用于Gibson組裝,這是一種在恒溫條件下有效連接帶有多個重疊序列片段的技術。-從完全連接的環狀雙鏈DNA中去除不完全連接產物。-降解堿裂解質粒提取方法中產生的變性DNA,增加超螺旋DNA比例,提高DNA克隆和轉染效率。-降解質粒樣品中污染的線性化和切刻DNA。6.**操作條件**:推薦在37℃溫育30分鐘,之后加入EDTA至終濃度為20mM終止反應。7.**儲存條件**:-25~-15℃保存,有效期3年。8.**注意事項**:避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止本品失活。這些特點和技術應用使得T5核酸外切酶在分子生物學實驗中,尤其是在DNA克隆和基因片段組裝中,具有重要的應用價值。
磁珠法提取的DNA通常指的是通過磁珠吸附技術從樣本中純化得到的核酸,而基因組DNA(gDNA)是指一個生物體細胞核中包含的全套遺傳信息的DNA。兩者的主要區別在于:1.**來源和組成**:-磁珠法提取的DNA可以是基因組DNA,也可以是質粒DNA、線粒體DNA等其他類型的DNA。它是一個廣的概念,指的是通過磁珠法技術提取的任何類型的DNA。-基因組DNA特指一個生物體細胞核中的DNA,包含了所有的基因信息,以及可能的非編碼區域。它通常包含了大量的堿基對,如人類基因組由大約30億個堿基對組成。2.**純度和應用**:-磁珠法提取的DNA的純度和質量取決于提取過程中的裂解、吸附、洗滌和洗脫步驟,以及磁珠的質量和操作條件。高質量的磁珠法提取的DNA可以用于多種分子生物學實驗,如PCR、克隆、測序等。-基因組DNA的提取通常需要考慮其完整性和純度,以確保后續實驗的準確性。基因組DNA提取的難點在于血液樣本成分復雜,且白細胞體積占比低,因此提取純化難度較高。3.**提取方法**:-磁珠法提取DNA是一種高效、快速的核酸提取技術,它利用磁珠表面修飾的特定官能團與核酸的特異性結合,通過外加磁場實現核酸與雜質的快速分離。Hifair? Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit :適用于從總RNA或mRNA模板合成鏈cDNA,具有高熱穩定性。
在DNA提取過程中避免RNA污染的關鍵在于采取一系列措施來確保RNA被有效去除或降解,同時保護DNA的完整性和純度。以下是一些確保DNA提取過程中避免RNA污染的策略:1.**使用專門的DNA提取試劑盒**:選擇高質量的DNA提取試劑盒,這些試劑盒通常已經包含了防止RNA污染的措施,如特定的裂解液和純化步驟,能夠有效去除RNA。2.**加入RNA酶(RNase)處理**:在DNA提取過程中加入RNase處理步驟,可以有效地去除殘留的RNA污染。RNase是一種能夠特異性降解RNA的酶,可以在不影響DNA完整性的前提下去除RNA污染。3.**優化實驗操作步驟**:在破碎細胞時,選擇合適的破碎方法和破碎時間,避免過度破碎導致RNA的釋放;在DNA純化階段,控制好離心速度和時間,避免RNA的沉淀。4.**使用無RNase的試劑和耗材**:使用經過RNase-free處理的實驗器材和試劑,確保實驗過程中不會引入外源性RNA污染。5.**嚴格控制實驗環境**:保持實驗室臺面和工作區域干凈無塵,定期對實驗室進行消殺,避免RNA酶污染。6.**個人防護和操作規范**:在處理DNA樣品時,佩戴無菌手套和口罩,以減少呼吸道和皮膚污染的風險。使用不同的工具處理不同的樣品,或者在處理前后徹底清洗工具,避免交叉污染。泛素分子可以通過其內部的賴氨酸殘基(如Lys48)與其他泛素分子形成多聚泛素鏈。Recombinant Human IDH1 Protein,His Tag
CRISPR-Cas12a(以前稱為Cpf1)是一種類II型V型內切酶,偏好富含胸腺嘧啶的原間隔短回文重復序列鄰近基序。Recombinant Human Epiregulin
T7EndonucleaseI(T7EI)是一種特殊的DNA內切酶,具有以下特點:1.**識別錯配DNA**:T7EI能夠識別并切割不完全配對的DNA、十字型結構DNA、Holliday結構或交叉DNA以及異源雙鏈DNA。2.**切割位點**:T7EI切割錯配位點5'端的、第二或第三個磷酸二酯鍵。3.**靈敏度**:T7EI對錯配DNA的識別非常靈敏,能夠檢測并切割單堿基和多堿基的錯配。4.**應用**:T7EI常用于CRISPR/Cas9等基因編輯技術導致的基因突變的鑒定。它通過識別錯配DNA來幫助鑒定基因編輯是否成功以及是否有非目標效應。5.**直接電泳檢測**:T7EI的產物可以直接通過電泳進行檢測,這使得它在實驗操作中更為方便。6.**來源**:T7EI來源于大腸桿菌菌株,是一種麥芽糖結合蛋白(MBP)和T7核酸內切酶I(T7EI)的融合蛋白。7.**成本效益**:盡管T7EI在商業上使用時成本較高,但它在大規模樣本測試中,尤其是在基因突變鑒定方面,提供了一種有效的篩選方法。8.**特殊注意事項**:T7EI能夠識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導致的錯配DNA,但不能識別1bp的插入、缺失或突變。這些特點使得T7EndonucleaseI成為基因突變鑒定中一個非常有用的工具,尤其是在CRISPR/Cas9等基因編輯技術的應用中。Recombinant Human Epiregulin