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蘇州一體化逆轉(zhuǎn)錄多少錢(qián)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-04-04

miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA不同,成熟的miRNA的長(zhǎng)度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆蓋其全長(zhǎng)甚至有余,反向引物就無(wú)處安放了。那么如何實(shí)現(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增呢?解決方案就是在逆轉(zhuǎn)錄的時(shí)候設(shè)法增加逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度。普遍的方法有兩種,加尾法和莖環(huán)法。經(jīng)過(guò)加尾法或莖環(huán)法這種特殊的逆轉(zhuǎn)錄形式處理之后,得到的cDNA長(zhǎng)度從原始的20nt增加到80nt以上,這樣就能夠?qū)崿F(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增了。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):選擇合適的引物:但其對(duì)RNA的完整度和二級(jí)結(jié)構(gòu)的要求較高,而且不適用于原核生物。隨機(jī)引物可以根據(jù)堿基情況結(jié)合到幾乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。逆轉(zhuǎn)錄經(jīng)常與細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化有關(guān),艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程。蘇州一體化逆轉(zhuǎn)錄多少錢(qián)

逆轉(zhuǎn)錄酶是存在于RNA病毒體內(nèi)的依賴RNA的DNA聚合酶。RT-PCR實(shí)驗(yàn)中的逆轉(zhuǎn)錄酶需要具有以下二種活性:依賴RNA的DNA聚合酶活性:以RNA為模板合成cDNA的首先條鏈。依賴DNA的DNA聚合酶活性:以一條DNA鏈為模板合成互補(bǔ)的雙鏈DNA。在選擇逆轉(zhuǎn)錄酶時(shí),建議選擇無(wú)RNaseH①活性(RNaseH-)的逆轉(zhuǎn)錄酶。具有RNaseH活性的逆轉(zhuǎn)錄酶的RNaseH活性會(huì)與聚合酶活性競(jìng)爭(zhēng)RNA模板與DNA引物(或cDNA延伸鏈)形成的雜合鏈,并降解雜合鏈中的RNA鏈。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作為合成cDNA的有效底物,降低了cDNA合成的產(chǎn)量與長(zhǎng)度。成都快速逆轉(zhuǎn)錄酶公司逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過(guò)程需適當(dāng)?shù)腞NA質(zhì)量,過(guò)少或質(zhì)量不佳將影響擴(kuò)增效果。

逆轉(zhuǎn)錄的過(guò)程:生物體中的逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程就比較復(fù)雜,比如逆轉(zhuǎn)錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡(jiǎn)風(fēng)”,所有東西都?jí)嚎s到非常。比如它的基因組中,經(jīng)常有些基因是重疊、嵌套結(jié)構(gòu),充分利用每一個(gè)堿基。所以它也不會(huì)專門(mén)編碼一個(gè)引發(fā)酶來(lái)合成引物,它一般是在組裝時(shí)帶走宿主的tRNA,在下次侵染時(shí)當(dāng)作引物使用。被用作引物的tRNA會(huì)結(jié)合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復(fù)序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉(zhuǎn)錄。之后水解RNA鏈的時(shí)候,會(huì)留下一些片段作為復(fù)制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經(jīng)過(guò)一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長(zhǎng)末端重復(fù)(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時(shí)用來(lái)配對(duì)的序列,還有整合信號(hào)、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、polyA位點(diǎn)等重要結(jié)構(gòu)。

miRNA逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)法:首先需要進(jìn)行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統(tǒng)Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設(shè)計(jì)。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會(huì)形成二聚體時(shí)才能用。取200ul的PCR管,根據(jù)所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計(jì)算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應(yīng)體系說(shuō)明,依次向200μL的PCR管內(nèi)加入下列試劑:加樣結(jié)束后,移液器吹打混勻,低速離心數(shù)秒。將逆轉(zhuǎn)錄PCR管放入PCR擴(kuò)增儀內(nèi),調(diào)整參數(shù):37℃15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)),85℃5s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng)),4℃∞。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說(shuō)明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉(zhuǎn)錄引物,注意相應(yīng)地調(diào)整無(wú)酶水的體積和反應(yīng)溫度。逆轉(zhuǎn)錄是以RNA為模板合成DNA的過(guò)程,即RNA指導(dǎo)下的DNA合成。

逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)步驟:用SSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶進(jìn)行RT(20ul體積)1、準(zhǔn)備0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆轉(zhuǎn)錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。8、-20℃保存,或立即進(jìn)行PCR。MCERTmix含有比例優(yōu)化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可從RNA轉(zhuǎn)錄本的各個(gè)區(qū)域起始,并具有相同的逆轉(zhuǎn)錄效率,較大程度保證qPCR結(jié)果的真實(shí)性和可重復(fù)性。質(zhì)粒RNA檢測(cè)中的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)需要特定反應(yīng)體系。蘇州一體化逆轉(zhuǎn)錄多少錢(qián)

逆轉(zhuǎn)錄酶是逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的重要酶類。蘇州一體化逆轉(zhuǎn)錄多少錢(qián)

逆轉(zhuǎn)錄的端粒復(fù)制:逆轉(zhuǎn)錄經(jīng)常與細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化有關(guān),艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程。所以相關(guān)研究可以為很多疾病的研究和防治提供幫助。逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑就一直是藥物研發(fā)熱點(diǎn),例如抗HIV的nevirapine。逆轉(zhuǎn)錄酶缺乏校對(duì)(3'-5'核酸外切酶)功能,所以容易出錯(cuò)。這也是很多病毒容易突變進(jìn)化的原因,比如nevirapine就很容易被抵抗。不過(guò),校對(duì)功能與逆轉(zhuǎn)錄活性并不矛盾。有人使用改良的定向進(jìn)化策略從具有校對(duì)功能的DNA聚合酶(古細(xì)菌的DNA聚合酶B)進(jìn)化出高保真的耐熱逆轉(zhuǎn)錄酶,稱為逆轉(zhuǎn)錄異種聚合酶(reversetranscriptionxenopolymerase),證明校對(duì)與逆轉(zhuǎn)錄是兼容的。在科研中,RTX可用于RT-PCR等過(guò)程,能夠提高精確度及簡(jiǎn)化操作程序。蘇州一體化逆轉(zhuǎn)錄多少錢(qián)

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