RT-PCR逆轉錄引物設計原則:1.上下游引物要保守:擴增子長度需選擇一段保守片段(100-200bp)進行PCR擴增,選擇片段需跨越內含子,因內含子的基因組DNA序列不會被擴增,也可減少從污染的基因組DNA中擴增得到的假陽性風險。引物選取同樣需要保守。2.引物長度和Tm值:引物設計長度為18-25bp,Tm值在50-65℃之間,引物中GC含量在40-60%。設計引物時盡量避免出現4個或超過4個G堿基。RT-PCR實驗陰性對照:反轉錄陰性對照應包括在所有的RT-PCR的實驗中,用來檢測DNA是否污染(如基因組DNA或PCR產物)。該對照所指不加反轉錄酶,通過反轉錄過程得到cDNA在進行熒光定量PCR檢測。如檢測到擴增,則樣本中可能含有基因組DNA污染。質粒RNA檢測中的逆轉錄反應需要特定反應體系。武漢莖環法逆轉錄酶試劑研發
逆轉錄是指以RNA為模板合成DNA的過程,即將遺傳信息由RNA逆向傳給DNA的過程,其遺傳的傳遞方向與轉錄相反。反轉錄酶也可寫成逆轉錄酶又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。是以RNA為模板指導三磷酸脫氧核苷酸合成互補DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉錄酶和鼠類B型病毒的反轉錄酶都是一條多肽鏈。鳥類RNA病毒的反轉錄酶則由兩上亞基結構。真核生物中也都分離出具有不同結構的反轉錄酶。RNA指導的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。帶gDNA Remover反轉錄測序逆轉錄可用于新型病毒的檢測。
反轉錄酶的用處:由它催化轉錄合成的DNA稱為互補DNA(cDNA)。通常情況下,細胞內的轉錄應由DNA到RNA的,所得RNA為信使RNA(mRNA)供蛋白質合成作模板用。而在部分RNA病毒中,要實現自身擴增,必須具有DNA,因此先由RNA逆轉錄合成cDNA再由cDNA轉錄出RNA。逆轉錄酶可用RT—PCR,將RNA轉變為DNA后擴增,以獲得RNA的序列。1970年從致死RNA病毒中發現了反轉錄酶,并認為此酶與病毒的致死性質有關。反轉錄酶也分布于某些正常細胞和胚胎細胞。反轉錄酶的發現表明不能把生物的遺傳信息由DNA→mRNA→蛋白質非常化,遺傳信息也可以從RNA傳遞到DNA。它促進了分子生物學、生物化學和病毒學的研究,已成為研究這些學科的有力工具。
逆轉錄酶實驗流程:從細胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉錄酶、引物、dNTPs的反應體系中→退火,引物與RNA鏈配對→延伸,逆轉錄酶合成互補cDNA鏈變性→常規PCR反應流程(變性、退火、延伸,如此多次循環)。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實驗操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構建cDNA文庫(即cDNA合成與PCR反應在同一Buffer及酶中進行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過程。兩步法RT-PCR首先用反轉錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進行PCR,即RNA反轉錄與PCR擴增分兩步進行。逆轉錄PCR在檢測病毒、診斷疾病等方面有普遍應用。
逆轉錄是一種重要的生物學現象,它在生物體內發揮著重要的作用。逆轉錄是指將RNA轉錄成DNA的過程,與正常的DNA轉錄成RNA的過程相反。這個過程由逆轉錄酶來完成,而逆轉錄酶是一種酶類蛋白質,普遍存在于病毒和一些細胞中。逆轉錄的重要性在于它是某些病毒的復制過程中必不可少的一步。許多病毒的遺傳物質是RNA分子,而它們必須先將RNA轉錄成DNA,才能利用細胞的合成機制來進行復制。這種轉錄過程一旦完成,病毒的DNA就可以與宿主細胞的DNA結合在一起,從而使病毒的遺傳物質被復制并傳遞下去。逆轉錄實驗過程需適當的RNA質量,過少或質量不佳將影響擴增效果。上海帶gDNA Remover逆轉錄酶
逆轉錄實驗時要記錄反應體系的溫度、時間、反應試劑的添加量等參數。武漢莖環法逆轉錄酶試劑研發
逆轉錄(reversetranscription)是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導下的DNA合成。此過程中,核酸合成與轉錄(DNA到RNA)過程與遺傳信息的流動方向(RNA到DNA)相反,故稱為逆轉錄。逆轉錄與反轉錄嚴格意義上來說沒有什么區別,但是逆轉錄是某些病毒的自主行為,如逆轉錄病毒,它們在整合到宿主細胞內前以RNA為模板形成DNA的過程;反轉錄是進行基因工程過程中,人為地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之為模板人工合成DNA的過程。二者雖同為RNA→DNA的過程,但地點不同,相對性的來說,逆轉錄在體內,反轉錄在體外。武漢莖環法逆轉錄酶試劑研發
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