莖環法逆轉錄是一種逆轉錄反應的技術,它利用莖環結構的RNA分子作為反向引物,在逆轉錄過程中特異性地擴增目標RNA分子。該技術在分子生物學和醫學研究中得到了普遍的應用,特別是在RNA的研究和檢測中具有獨特的優勢。莖環法逆轉錄技術的基本原理是利用逆轉錄酶和莖環結構的RNA作為反向引物,將RNA逆轉錄成cDNA,并在PCR反應中擴增。莖環結構的RNA分子具有較高的穩定性和特異性,可以特異性地識別和結合目標RNA分子,從而在逆轉錄反應中作為反向引物擴增目標cDNA。此外,由于莖環結構的RNA分子與目標RNA分子的堿基序列互補,因此莖環法逆轉錄技術可以避免隨機引物引起的非特異擴增。逆轉錄的反應機理是RNA模板上的DNA合成。廣州cDNA合成反轉錄生產商
逆轉錄(reversetranscription)是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導下的DNA合成。此過程中,核酸合成與轉錄(DNA到RNA)過程與遺傳信息的流動方向(RNA到DNA)相反,故稱為逆轉錄。逆轉錄與反轉錄嚴格意義上來說沒有什么區別,但是逆轉錄是某些病毒的自主行為,如逆轉錄病毒,它們在整合到宿主細胞內前以RNA為模板形成DNA的過程;反轉錄是進行基因工程過程中,人為地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之為模板人工合成DNA的過程。二者雖同為RNA→DNA的過程,但地點不同,相對性的來說,逆轉錄在體內,反轉錄在體外。深圳莖環法逆轉錄酶公司逆轉錄實驗過程中需要考慮RNA模板質量和RNA純化的方法。
逆轉錄實驗步驟:引物濃度計算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為XuM(pmol/ul)加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆轉錄酶進行RT(10ul體積)1、準備0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍離心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆轉錄酶。5、稍離心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min滅活AMV。7、立即PCR或-20℃保存。逆轉錄實驗時注意事項:為避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。
反轉錄酶的注意事項,隨機引物:適合各種RNA的RT,尤其適合模板豐度很低的情況(比如某個gene表達量很低)。選擇隨機引物時,首先鏈cDNA合成反應中就是以所有的RNA為模板,然后進行PCR反應時設計引物進行特異性擴增。同時要注意隨機引物的量和總RNA量之間的關系,一般建議每5μg總RNA的隨機引物的用量為50ng,如果每5μg總RNA的隨機引物的用量超過250ng,可能會導致小片段產物(<500bp)的增加和長片斷、全長產物產物的降低。酵母菌逆轉錄酶是逆轉錄酶家族中的一個重要表示,逆轉錄在研究RNA表達調控等領域有普遍的應用前景。逆轉錄是一種將RNA反轉錄為DNA的生物化學過程。
逆轉錄酶的質量控制:1.切口酶:在與200單位酶37oC保溫60分鐘后,超螺旋質粒保留在90%以上。2.DNase測定:200單位酶與50ng3H-DNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于1%。3.RNase測定:200單位酶與50ng3H-RNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于3%。4.首先鏈cDNA的反應:在標準化的反應中,200單位酶催化從1mg1.2kbRNA或1mg7.5kbRNA將同位素摻入到cDNA中,通過放射自顯影,對于1.2kb的RNA,產物cDNA是單一的、全長的條帶。對于7.5kb的RNA產物有部分是全長的條帶。用這二種RNA放射性轉換到cDNA中有12%。5.RNaseH活性:200單位酶與polyA:polydT37oC保溫60分鐘,釋放出的放射性要低于1%。逆轉錄過程由逆轉錄酶催化,此酶也稱依賴RNA的DNA聚合酶,即以RNA為模板催化DNA鏈的合成。武漢miQP2逆轉錄試劑價格
逆轉錄PCR反應過程中要注意反應管中溶液面積不宜過高,避免泡沫問題。廣州cDNA合成反轉錄生產商
逆轉錄酶實驗流程:從細胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉錄酶、引物、dNTPs的反應體系中→退火,引物與RNA鏈配對→延伸,逆轉錄酶合成互補cDNA鏈變性→常規PCR反應流程(變性、退火、延伸,如此多次循環)。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實驗操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構建cDNA文庫(即cDNA合成與PCR反應在同一Buffer及酶中進行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過程。兩步法RT-PCR首先用反轉錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進行PCR,即RNA反轉錄與PCR擴增分兩步進行。廣州cDNA合成反轉錄生產商
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