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深圳快速逆轉錄混合企業

來源: 發布時間:2023-04-29

逆轉錄的過程與端粒復制,逆轉錄酶通常具有多種活性,如逆轉錄活性、復制活性與RNA酶H活性。逆轉錄活性可以RNA為模板,合成與其序列互補的DNA鏈,生成DNA-RNA雜合雙鏈。RNA酶H活性可以水解雜合雙鏈中的RNA,得到與RNA互補的DNA單鏈(cDNA)。復制活性則用來合成雙鏈DNA。HIV逆轉錄酶的活性部位。與復制類似,逆轉錄也是由5’向3’合成DNA,要求有模板和不少于四個核苷酸的引物。各種DNA聚合酶活性都需要引物,只有確認引物正確配對,才會進行DNA的合成。這是保證其忠實性的重要手段,逆轉錄酶也不例外。實驗室合成cDNA時,經常會用合成的寡聚T(oligodT)作為引物,與mRNA的polyA配對。這個過程比較簡單,因為引物結合在RNA鏈的末端,所以整條鏈的逆轉錄是一次性完成的。逆轉錄實驗前應反復檢查所有試劑盒的有效期和使用條件。深圳快速逆轉錄混合企業

RNA逆轉錄實驗注意事項:RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反轉錄之前還需要對RNA濃度進行測定。一般反轉錄試劑盒會對上樣量有要求,建議totalRNA上樣量小于5μg。超過這個范圍,會使反轉錄產物產生偏好性(表達豐度高的基因優先被反轉錄)而造成定量結果不準確。逆轉錄引物的選擇:逆轉錄引物一般包含3種:oligodT引物,隨機引物和特異性引物。對于短的且不具備發卡結構的真核細胞mRNA,三種都可用。逆轉錄實驗過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。深圳快速逆轉錄混合企業逆轉錄酶通常具有多種活性,如逆轉錄活性、復制活性與RNA酶H活性。

逆轉錄酶的質量控制:1.切口酶:在與200單位酶37oC保溫60分鐘后,超螺旋質粒保留在90%以上。2.DNase測定:200單位酶與50ng3H-DNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于1%。3.RNase測定:200單位酶與50ng3H-RNA37oC保溫60分鐘,分解出的放射性低于3%。4.首先鏈cDNA的反應:在標準化的反應中,200單位酶催化從1mg1.2kbRNA或1mg7.5kbRNA將同位素摻入到cDNA中,通過放射自顯影,對于1.2kb的RNA,產物cDNA是單一的、全長的條帶。對于7.5kb的RNA產物有部分是全長的條帶。用這二種RNA放射性轉換到cDNA中有12%。5.RNaseH活性:200單位酶與polyA:polydT37oC保溫60分鐘,釋放出的放射性要低于1%。

M-MLV反轉錄酶比AMV反轉錄酶缺乏連續性,因此要獲得像AMV反轉錄酶反應中產生同樣量的cDNA就要求使用較多單位的M-MLV反轉錄酶。用1微克的mRNA起始合成首先條鏈的cDNA,要用8單位的M-MLV反轉錄酶才相當于1單位的AMV反轉錄酶的作用。該酶很容易被亞精胺(Spermidine)所抑制,該酶非常不能用Promega的RiboprobeAMV反轉錄酶5X反應緩沖液,也不能用Promega的RiboclonecDNA首先條鏈緩沖液,因為這二種緩沖液均含有亞精胺。逆轉錄實驗可以選擇加入RNA合成抑制劑RNAse防止RNA降解和污染,逆轉錄實驗過程需適當的RNA質量,過少或質量不佳將影響擴增效果。逆轉錄實驗前要對反應體系進行無RNA和無反轉錄酶的對照。

逆轉錄PCR的用途普遍,可用于分析基因的轉錄產物、檢測細胞中RNA病毒的含量、合成cDNA探針、直接克隆特定基因的cDNA序列等。如在臨床上RT-PCR可以用于遺傳病診斷、病癥檢測、檢測病人標本中的RNA病毒,如HAV、HCR、HIV等。在植物方面RT-PCR常用于研究環境脅迫對植物基因表達的影響,以及在特定的環境或生長階段中植物體不同部位基因表達的差異性。使用RT-PCR檢測分析RNA轉錄產物具有以下突出的優點:理論上可以檢測幾乎任何基因的轉錄產物;可以實現極為微量RNA樣品(ng級別)的檢測;樣品耐受性好,未經純化的粗制生物樣品也可以用于檢測。逆轉錄反應首先需要逆轉錄酶的反應活性。南京莖環法逆轉錄試劑費用

高效的逆轉錄體系可提高反應效率和檢測靈敏度。深圳快速逆轉錄混合企業

逆轉錄實驗步驟:引物濃度計算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為XuM(pmol/ul)加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆轉錄酶進行RT(10ul體積)1、準備0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍離心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆轉錄酶。5、稍離心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min滅活AMV。7、立即PCR或-20℃保存。逆轉錄實驗時注意事項:為避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。深圳快速逆轉錄混合企業

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