逆轉錄酶是存在于RNA病毒體內的依賴RNA的DNA聚合酶。RT-PCR實驗中的逆轉錄酶需要具有以下二種活性:依賴RNA的DNA聚合酶活性:以RNA為模板合成cDNA的首先條鏈。依賴DNA的DNA聚合酶活性:以一條DNA鏈為模板合成互補的雙鏈DNA。在選擇逆轉錄酶時,建議選擇無RNaseH①活性(RNaseH-)的逆轉錄酶。具有RNaseH活性的逆轉錄酶的RNaseH活性會與聚合酶活性競爭RNA模板與DNA引物(或cDNA延伸鏈)形成的雜合鏈,并降解雜合鏈中的RNA鏈。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作為合成cDNA的有效底物,降低了cDNA合成的產量與長度。逆轉錄實驗避免RNA樣品的過凍、過熱處理,影響逆轉錄反應的效果。廣州莖環法逆轉錄混合供貨商
反轉錄酶的注意事項,引物的選擇,OligodT:選擇OligodT時,要求RNA必須有PolyA,所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT,所以對RNA樣品的質量要求較高,較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應,建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機引物和特異性引物的穩定性要好。特異性引物:特異性引物只能用你設計引物時的下游引物做RT,引物設計質量影響RT的結果,而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以按照說明書按照一個溫度做不是較佳選擇,一般不推薦。廣州彩色逆轉錄供貨商逆轉錄實驗要使用高質量的反轉錄酶和逆轉錄引物,避免引物交叉污染。
逆轉錄是指以RNA為模板合成與其互補的cDNA的過程。逆轉錄PCR是將RNA的逆轉錄(reversetranscription)和cDNA的聚合酶鏈式反應(PCR)相結合的技術,故逆轉錄稱為RT-PCR或反轉錄PCR。逆轉錄PCR實驗原理是,提取組織或細胞中的總RNA,以RNA為模板,利用逆轉錄酶反轉錄成cDNA,再以cDNA鏈為模板進行PCR擴增,從而獲得大量拷貝。逆轉錄PCR的出現使RNA檢測的靈敏性提高了幾個數量級,使一些極為微量RNA樣品分析成為可能。RNA逆轉錄實驗注意事項:選擇合適的引物:隨機引物法逆轉錄產生的片段較小,很難得到全長轉錄本的cDNA。單獨選擇某一種引物,實驗可能都不完美,具體需要根據實驗目的來確定。
逆轉錄酶實驗一步法與兩步法具有以下區別:一步法比兩步法更快速、簡便、減少了污染機會、減少了RNA二級結構、減少了PCR反應的錯配率;兩步法的優勢在于中間產物cDNA,便于保存;且第二步PCR只取逆轉錄反應產物的1/10進行反應,有利于PCR條件的調整,實驗重現性強;兩步法可以在第二步PCR反應體系中加入特異性引物,其靈敏度比一步法高;兩步法包括首先鏈cDNA合成和隨后的PCR反應,容易產生污染問題;兩步法的實驗預算要低于一步法。核酸合成與轉錄過程與遺傳信息的流動方向相反,故稱為逆轉錄。
反轉錄酶的注意事項,在進行RT反應之前,應考慮以下幾個方面:RNA:成功的cDNA合成來自高質量的RNA,高質量的RNA至少應保證全長并且不含逆轉錄酶的抑制劑,如EDTA或SDS。在提取RNA的過程中,要特別防止RNase的污染,同時在逆轉錄反應中經常加入RNase抑制劑以增加cDNA合成的長度和產量。RNase抑制劑要在首先鏈cDNA合成反應中,在緩沖液和還原劑(如DTT)存在的條件下加入,因為cDNA合成前的過程會使抑制劑變性,從而釋放結合的可以降解RNA的RNase。蛋白RNase抑制劑只防止RNaseA,B,C對RNA的降解,并不能防止皮膚上的RNase,因此盡管使用了這些抑制劑,也要小心不要從手指上引入RNase,實驗過程中經常更換新手套。逆轉錄經常與細胞惡性轉化有關,艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉錄過程。上海一體化反轉錄供貨商
逆轉錄實驗過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。廣州莖環法逆轉錄混合供貨商
逆轉錄的過程:生物體中的逆轉錄過程就比較復雜,比如逆轉錄病毒(retrovirus)。病毒是真正的“極簡風”,所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中,經常有些基因是重疊、嵌套結構,充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發酶來合成引物,它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA,在下次侵染時當作引物使用。被用作引物的tRNA會結合在病毒基因組RNA鏈的中間,所以首先次只能合成出一部分cDNA,然后利用基因組RNA兩端的一段重復序列,“跳”回另一端,完成整條鏈的逆轉錄。之后水解RNA鏈的時候,會留下一些片段作為復制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經過一次跳躍(jump),以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列,稱為長末端重復(longterminalrepeats,LTR)。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列,還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結構。廣州莖環法逆轉錄混合供貨商
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