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上海cDNA合成逆轉錄公司

來源: 發布時間:2023-05-18

RNA逆轉錄實驗注意事項:去除基因組DNA污染:殘留的基因組DNA(gDNA)會對熒光定量結果造成很大的干擾,為了使結果更加的真實、可重復,我們需要去除gDNA干擾。我們可以在引物設計時避免gDNA的擴增,比如將上下游引物分別設在不同的外顯子上;或者在提取RNA后使用DNaseI處理以除去gDNA。較后,我們還有非常法寶,選擇一款具有gDNA去除功能的逆轉錄試劑盒,一步到位去除gDNA,省心省力max。RNA逆轉錄實驗注意事項:逆轉錄酶熱穩定性:逆轉錄酶在整個反轉錄體系中具有關鍵性影響。除了活性以外,逆轉錄酶的熱穩定性同樣很重要,在較高溫度下進行逆轉錄,能夠減少RNA的二級結構,增加逆轉錄的效率。野生型的M-MLV逆轉錄酶很“怕熱”,高于37℃時,穩定性大幅下降。質粒RNA檢測中的逆轉錄反應需要特定反應體系。上海cDNA合成逆轉錄公司

逆轉錄實驗步驟:引物濃度計算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為XuM(pmol/ul)加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆轉錄酶進行RT(10ul體積)1、準備0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍離心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆轉錄酶。5、稍離心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min滅活AMV。7、立即PCR或-20℃保存。逆轉錄實驗時注意事項:為避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。上海cDNA合成逆轉錄公司逆轉錄是2代測序、單細胞測序等技術的前置步驟。

逆轉錄(reversetranscription)是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導下的DNA合成。此過程中,核酸合成與轉錄(DNA到RNA)過程與遺傳信息的流動方向(RNA到DNA)相反,故稱為逆轉錄。逆轉錄與反轉錄嚴格意義上來說沒有什么區別,但是逆轉錄是某些病毒的自主行為,如逆轉錄病毒,它們在整合到宿主細胞內前以RNA為模板形成DNA的過程;反轉錄是進行基因工程過程中,人為地提取出所需要的目的基因的信使RNA,并以之為模板人工合成DNA的過程。二者雖同為RNA→DNA的過程,但地點不同,相對性的來說,逆轉錄在體內,反轉錄在體外。

RT-PCR逆轉錄引物設計原則:1.上下游引物要保守:擴增子長度需選擇一段保守片段(100-200bp)進行PCR擴增,選擇片段需跨越內含子,因內含子的基因組DNA序列不會被擴增,也可減少從污染的基因組DNA中擴增得到的假陽性風險。引物選取同樣需要保守。2.引物長度和Tm值:引物設計長度為18-25bp,Tm值在50-65℃之間,引物中GC含量在40-60%。設計引物時盡量避免出現4個或超過4個G堿基。RT-PCR實驗陰性對照:反轉錄陰性對照應包括在所有的RT-PCR的實驗中,用來檢測DNA是否污染(如基因組DNA或PCR產物)。該對照所指不加反轉錄酶,通過反轉錄過程得到cDNA在進行熒光定量PCR檢測。如檢測到擴增,則樣本中可能含有基因組DNA污染。逆轉錄實驗前要對反應體系進行無RNA和無反轉錄酶的對照。

逆轉錄酶(M-MLV)從MoloneyMurineLeukemiaVirus分離出來,可用于合成首先鏈cDNA、制作cDNA探針、RNA轉錄、測序和RNA的逆轉錄反應。本酶是通過點突變使RNaseH活性缺失,所以它具有的DNA聚合酶的活性與野生型相同,同時其延伸能力也有明顯提高。逆轉錄酶(M-MLV)一個活性單位定義為在37℃,10min條件下,使1nmol的脫氧核糖核酸摻入酸性沉淀物質所需的酶量。逆轉錄酶的三個功能:1、RNA為模板指導的DNA聚合酶活性;2、DNA為模板指導的DNA聚合酶活性;3、RNaseh活性。逆轉錄實驗相關關器材如逆轉錄儀需經常檢查,以保證反應可靠性。上海cDNA合成逆轉錄公司

逆轉錄實驗前應反復檢查所有試劑盒的有效期和使用條件。上海cDNA合成逆轉錄公司

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