反轉錄酶的注意事項，引物的選擇，OligodT：選擇OligodT時，要求RNA必須有PolyA，所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT，所以對RNA樣品的質量要求較高，較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應，建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機引物和特異性引物的穩定性要好。特異性引物：特異性引物只能用你設計引物時的下游引物做RT，引物設計質量影響RT的結果，而且不同引物退火溫度本來就不相同，所以按照說明書按照一個溫度做不是較佳選擇，一般不推薦。逆轉錄實驗過程中要使用干燥無菌的管頭和標本采集器避免受外界污染。揚州一步法逆轉錄混合

逆轉錄的過程：生物體中的逆轉錄過程就比較復雜，比如逆轉錄病毒（retrovirus）。病毒是真正的“極簡風”，所有東西都壓縮到非常。比如它的基因組中，經常有些基因是重疊、嵌套結構，充分利用每一個堿基。所以它也不會專門編碼一個引發酶來合成引物，它一般是在組裝時帶走宿主的tRNA，在下次侵染時當作引物使用。被用作引物的tRNA會結合在病毒基因組RNA鏈的中間，所以首先次只能合成出一部分cDNA，然后利用基因組RNA兩端的一段重復序列，“跳”回另一端，完成整條鏈的逆轉錄。之后水解RNA鏈的時候，會留下一些片段作為復制的引物。雙鏈DNA的合成同樣也需要經過一次跳躍（jump），以合成完整雙鏈。較后兩端具有相同的序列，稱為長末端重復（longterminalrepeats，LTR）。LTR不只包含跳躍時用來配對的序列，還有整合信號、啟動子、增強子、polyA位點等重要結構。揚州一步法逆轉錄混合逆轉錄也可作為RNA表達譜的分析方法。

逆轉錄酶是存在于RNA病毒體內的依賴RNA的DNA聚合酶。RT-PCR實驗中的逆轉錄酶需要具有以下二種活性：依賴RNA的DNA聚合酶活性：以RNA為模板合成cDNA的首先條鏈。依賴DNA的DNA聚合酶活性：以一條DNA鏈為模板合成互補的雙鏈DNA。在選擇逆轉錄酶時，建議選擇無RNaseH①活性（RNaseH-）的逆轉錄酶。具有RNaseH活性的逆轉錄酶的RNaseH活性會與聚合酶活性競爭RNA模板與DNA引物（或cDNA延伸鏈）形成的雜合鏈，并降解雜合鏈中的RNA鏈。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作為合成cDNA的有效底物，降低了cDNA合成的產量與長度。

多逆轉錄酶都具有多種酶活性，DNA指導的DNA聚合酶活性；以反轉錄合成的首先條DNA單鏈為模板，以dNTP為底物，再合成第二條DNA分子。除此之外，有些反轉錄酶還有DNA內切酶活性，這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關。反轉錄酶的發現對于遺傳工程技術起了很大的推動作用，目前它已成為一種重要的工具酶。用組織細胞提取mRNA并以它為模板，在反轉錄酶的作用下，合成出互補的DNA(cDNA)，由此可構建出cDNA文庫(cDNalibrary)，從中篩選特異的目的基因，這是在基因工程技術中較常用的獲得目的基因的方法。逆轉錄實驗過程需適當的RNA質量，過少或質量不佳將影響擴增效果。

miRNA的加尾法逆轉錄和qPCR，miRNA與mRNA不同，成熟的miRNA的長度只有20nt左右，非常短，通常正向引物就足以覆蓋其全長甚至有余，反向引物就無處安放了。那么如何實現miRNA的qPCR擴增呢？解決方案就是在逆轉錄的時候設法增加逆轉錄產物長度。普遍的方法有兩種，加尾法和莖環法。經過加尾法或莖環法這種特殊的逆轉錄形式處理之后，得到的cDNA長度從原始的20nt增加到80nt以上，這樣就能夠實現miRNA的qPCR擴增了。RNA逆轉錄實驗注意事項：選擇合適的引物：但其對RNA的完整度和二級結構的要求較高，而且不適用于原核生物。隨機引物可以根據堿基情況結合到幾乎所有的RNA上，包括mRNA、tRNA和rRNA。逆轉錄后的DNA可直接用于基因克隆或測序等應用。杭州快速逆轉錄試劑測序

逆轉錄可改變RNA的信息內容，為研究RNA功能提供基礎。揚州一步法逆轉錄混合

逆轉錄實驗步驟：用SSⅢ逆轉錄酶進行RT（20ul體積）1、準備0、65ml的EP管。2、冰上操作：在EP管中加入10ulDEPC水，1ul引物，1ul模板RNA，1uldNTP，短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后，立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后，冰上操作：加入4ul5×First-StrandBuffer，1ul0.1MDTT，1ulRNAseInhibitor，1ulSSⅢ逆轉錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進行逆轉錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉錄酶。8、－20℃保存，或立即進行PCR。MCERTmix含有比例優化的Oligo(dT)和RandomPrimers，使cDNA合成可從RNA轉錄本的各個區域起始，并具有相同的逆轉錄效率，較大程度保證qPCR結果的真實性和可重復性。揚州一步法逆轉錄混合

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