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長春市逆轉錄

來源: 發布時間:2023-06-17

反轉錄酶的選擇:反轉錄酶(Reversetranscriptase)又稱逆轉錄酶。是以RNA為模板指導dNTP合成互補DNA(cDNA)的酶。一部分反轉錄酶具有RNA酶活性,能夠在轉錄后降解RNA-DNA雜交鏈中的RNA鏈。如果反轉錄酶沒有Rnase酶活性,可加入RNaseH來獲得更高的qPCR效率。常用的酶包括Money鼠白血病病毒(MMLV)反轉錄酶和禽成髓細胞瘤病毒(AMV)反轉錄酶。依據RT-PCR,理想的狀態下是選擇具有較高熱穩定性的反轉錄酶,cDNA的合成才能在較高的溫度下進行,確保成功轉錄具有較高二級結構的RNA,并確保在整個反應過程中的全部活性,從而得到質量更高的cDNA。逆轉錄酶還有DNA內切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關。長春市逆轉錄

逆轉錄的發現有重要的理論意義和實踐意義。(1)在致死病毒的研究中發現了病基因,在人類一些病細胞如膀胱病、小細胞肺病等細胞中,也分離出與病毒病基因相同的堿基序列,稱為細胞病基因或原病基因。病基因的發現為疙瘩發病機理的研究提供了很有前途的線索。(2)在實際工作中有助于基因工程的實施。由于目的基因的轉錄產物易于制備,可將mRNA反向轉錄形成DNA用以獲得目的基因。逆轉錄酶實驗操作注意事項:RNA提取一定要迅速,樣本要新鮮,組織盡量在液氮中研磨;RNA提取完馬上進行逆轉錄不要拖延,新提的RNA很容易降解;逆轉錄反應過程,需建立無RNAase環境,以避免模板RNA降解。RNase是RNA水解酶的統稱,包含RNaseA,RNaseH等,RNaseA可以水解單雙鏈RNA,RNaseH主要水解RNA與DNA雜交雙鏈中的RNA。廣州miQP2逆轉錄哪家好逆轉錄實驗過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。

逆轉錄實驗步驟:引物濃度計算方法:(新合成的引物的稀釋)假如終濃度為XuM(pmol/ul)加DEPC水體積(ul)=(OD×33×1000000)/(分子量×X)。用AMV逆轉錄酶進行RT(10ul體積)1、準備0.65mlEP管。2、加入4.5ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA。3、稍離心,100℃沸水裕1min。4、加入0.5uldNTP,2ul5×Buffer,1ulAMV逆轉錄酶。5、稍離心,封口膜封口,42℃水浴90℃作RT。6、100℃沸水裕3min滅活AMV。7、立即PCR或-20℃保存。逆轉錄實驗時注意事項:為避免RNA酶污染,在RT中仍要佩戴一次性手套和口罩。

逆轉錄實驗過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉錄酶的選擇,逆轉錄實驗前要對反應體系進行無RNA和無反轉錄酶的對照。多逆轉錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①RNA指導的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。②RNaseH活性;由反轉錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5′端水解掉RNA分子。逆轉錄是2代測序、單細胞測序等技術的前置步驟。

反轉錄酶的用處:由它催化轉錄合成的DNA稱為互補DNA(cDNA)。通常情況下,細胞內的轉錄應由DNA到RNA的,所得RNA為信使RNA(mRNA)供蛋白質合成作模板用。而在部分RNA病毒中,要實現自身擴增,必須具有DNA,因此先由RNA逆轉錄合成cDNA再由cDNA轉錄出RNA。逆轉錄酶可用RT—PCR,將RNA轉變為DNA后擴增,以獲得RNA的序列。1970年從致死RNA病毒中發現了反轉錄酶,并認為此酶與病毒的致死性質有關。反轉錄酶也分布于某些正常細胞和胚胎細胞。反轉錄酶的發現表明不能把生物的遺傳信息由DNA→mRNA→蛋白質非常化,遺傳信息也可以從RNA傳遞到DNA。它促進了分子生物學、生物化學和病毒學的研究,已成為研究這些學科的有力工具。逆轉錄實驗反應過程中需控制反應溫度,時間和pH值等指標。長春市逆轉錄

逆轉錄實驗過程中要使用干燥無菌的管頭和標本采集器避免受外界污染。長春市逆轉錄

逆轉錄PCR的用途普遍,可用于分析基因的轉錄產物、檢測細胞中RNA病毒的含量、合成cDNA探針、直接克隆特定基因的cDNA序列等。如在臨床上RT-PCR可以用于遺傳病診斷、病癥檢測、檢測病人標本中的RNA病毒,如HAV、HCR、HIV等。在植物方面RT-PCR常用于研究環境脅迫對植物基因表達的影響,以及在特定的環境或生長階段中植物體不同部位基因表達的差異性。使用RT-PCR檢測分析RNA轉錄產物具有以下突出的優點:理論上可以檢測幾乎任何基因的轉錄產物;可以實現極為微量RNA樣品(ng級別)的檢測;樣品耐受性好,未經純化的粗制生物樣品也可以用于檢測。長春市逆轉錄

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