RNA逆轉錄實驗注意事項:RNA定量:除了掌握RNA的完整性之外,反轉錄之前還需要對RNA濃度進行測定。一般反轉錄試劑盒會對上樣量有要求,建議totalRNA上樣量小于5μg。超過這個范圍,會使反轉錄產物產生偏好性(表達豐度高的基因優先被反轉錄)而造成定量結果不準確。逆轉錄引物的選擇:逆轉錄引物一般包含3種:oligodT引物,隨機引物和特異性引物。對于短的且不具備發卡結構的真核細胞mRNA,三種都可用。逆轉錄實驗過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。逆轉錄實驗可以選擇加入RNA合成抑制劑RNAse防止RNA降解和污染。南昌一體化逆轉錄酶
反轉錄酶的注意事項,隨機引物:適合各種RNA的RT,尤其適合模板豐度很低的情況(比如某個gene表達量很低)。選擇隨機引物時,首先鏈cDNA合成反應中就是以所有的RNA為模板,然后進行PCR反應時設計引物進行特異性擴增。同時要注意隨機引物的量和總RNA量之間的關系,一般建議每5μg總RNA的隨機引物的用量為50ng,如果每5μg總RNA的隨機引物的用量超過250ng,可能會導致小片段產物(<500bp)的增加和長片斷、全長產物產物的降低。酵母菌逆轉錄酶是逆轉錄酶家族中的一個重要表示,逆轉錄在研究RNA表達調控等領域有普遍的應用前景。廣州帶gDNA Remover反轉錄逆轉錄在病毒學、免疫學等領域有普遍的應用。
加尾法逆轉錄的較大特點在于:對于抽提純化的miRNA,進行無差別加尾。因此,如果用戶需要對樣本中的多個miRNA進行考察,一次逆轉錄即可完成對所有qPCR模板的制備。qPCR引物方面,miRNA以及內參的反向引物都是通用引物R,不同的只是正向引物。因此在設計加尾法miRNA的qPCR引物時,只需設計特異性正向引物即可,正向引物的特異性直接決定了實驗結果的好壞。總之,加尾法適合對樣本中多個miRNA的快速檢測。引物設計簡單,但有非特異性的風險。由于其特殊的加PolyA機制,因此miRNA加尾法逆轉錄是無法只通過常規的mRNA逆轉錄試劑盒完成的。
逆轉錄的端粒復制:對于線性基因組,其滯后鏈的末端是無法完整復制的,每次約損失30-200個核苷酸(Cells.2020Feb22;9(2).)。這樣隨著細胞分裂,端粒會持續縮短,造成復制性衰老。對于大多數體細胞來說,端粒磨損是一種控制其分裂潛力的機制,但對于需要多次增殖的干細胞來說,必須設法維持端粒長度。端粒酶(telomerase)可以通過逆轉錄過程延長端粒。端粒酶由端粒酶RNA(TERC)和端粒酶逆轉錄酶(TERT)組成。TERT使用TERC作為模板,在染色體的單鏈末端合成端粒DNA的重復序列。大多數體細胞缺乏端粒酶活性,因而容易衰老。但未分化的生殖細胞,干細胞,活化的淋巴細胞和大多數疙瘩細胞具有高水平的端粒酶活性,可以克服端粒磨損并維持無限的細胞分裂。逆轉錄是2代測序、單細胞測序等技術的前置步驟。
逆轉錄酶實驗流程:從細胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉錄酶、引物、dNTPs的反應體系中→退火,引物與RNA鏈配對→延伸,逆轉錄酶合成互補cDNA鏈變性→常規PCR反應流程(變性、退火、延伸,如此多次循環)。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實驗操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構建cDNA文庫(即cDNA合成與PCR反應在同一Buffer及酶中進行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過程。兩步法RT-PCR首先用反轉錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進行PCR,即RNA反轉錄與PCR擴增分兩步進行。逆轉錄的反應條件和反應體系的優化十分重要。彩色逆轉錄混合公司
逆轉錄反應首先需要逆轉錄酶的反應活性。南昌一體化逆轉錄酶
反轉錄酶的用處:由它催化轉錄合成的DNA稱為互補DNA(cDNA)。通常情況下,細胞內的轉錄應由DNA到RNA的,所得RNA為信使RNA(mRNA)供蛋白質合成作模板用。而在部分RNA病毒中,要實現自身擴增,必須具有DNA,因此先由RNA逆轉錄合成cDNA再由cDNA轉錄出RNA。逆轉錄酶可用RT—PCR,將RNA轉變為DNA后擴增,以獲得RNA的序列。1970年從致死RNA病毒中發現了反轉錄酶,并認為此酶與病毒的致死性質有關。反轉錄酶也分布于某些正常細胞和胚胎細胞。反轉錄酶的發現表明不能把生物的遺傳信息由DNA→mRNA→蛋白質非?;?,遺傳信息也可以從RNA傳遞到DNA。它促進了分子生物學、生物化學和病毒學的研究,已成為研究這些學科的有力工具。南昌一體化逆轉錄酶
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