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無錫逆轉(zhuǎn)錄混合

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-09-02

逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉(zhuǎn)錄酶的選擇,逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)前要對反應(yīng)體系進(jìn)行無RNA和無反轉(zhuǎn)錄酶的對照。多逆轉(zhuǎn)錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉(zhuǎn)錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯(cuò)率比較高。②RNaseH活性;由反轉(zhuǎn)錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5′端水解掉RNA分子。逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象說明:至少在某些生物中,RNA同樣兼有遺傳信息傳遞和表達(dá)功能。無錫逆轉(zhuǎn)錄混合

逆轉(zhuǎn)錄酶的合成步驟:1、使用前每個(gè)組份輕輕混勻,然后2000rpm離心20s;2、取滅過菌且無核酸酶的0.2ml離心管,依次加入2~5μgRNAnμL;3、65℃保溫5min,然后冰浴5min;4、往3步驟中的0.2ml離心管依次加入下列組份:RNase抑制劑(40u/μL)0.5μL、10×M-MLVReactionBuffer2μL、DTT(200mM)1μL、逆轉(zhuǎn)錄酶(M-MLV)1μL;5、輕輕混勻后,然后2000rpm離心20s;6、先在37℃保溫1hr,然后70℃保溫15min;7、上述產(chǎn)物可立即進(jìn)行下一步的PCR反應(yīng)或-20℃保存。逆轉(zhuǎn)錄酶的質(zhì)量控制:物理純度:在SDS-PAGE上>90%純。儲存緩沖液:20mMTris-HClpH7.5;200mMNaCl;0.1mMEDTA;1mMDTT;0.01%NP-40(一種去垢劑)和50%甘油。反應(yīng)緩沖液:250mMTris-HClpH8.3;375mMKCl;15mMMgCl2;50mMDTT(以Part#M531A供應(yīng))。青島彩色逆轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄可改變RNA的信息內(nèi)容,為研究RNA功能提供基礎(chǔ)。

miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA不同,成熟的miRNA的長度只有20nt左右,非常短,通常正向引物就足以覆蓋其全長甚至有余,反向引物就無處安放了。那么如何實(shí)現(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增呢?解決方案就是在逆轉(zhuǎn)錄的時(shí)候設(shè)法增加逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長度。普遍的方法有兩種,加尾法和莖環(huán)法。經(jīng)過加尾法或莖環(huán)法這種特殊的逆轉(zhuǎn)錄形式處理之后,得到的cDNA長度從原始的20nt增加到80nt以上,這樣就能夠?qū)崿F(xiàn)miRNA的qPCR擴(kuò)增了。RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):選擇合適的引物:但其對RNA的完整度和二級結(jié)構(gòu)的要求較高,而且不適用于原核生物。隨機(jī)引物可以根據(jù)堿基情況結(jié)合到幾乎所有的RNA上,包括mRNA、tRNA和rRNA。

miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA與mRNA的在qRT-PCR過程有所不同。一般來講,mRNA比較長,其長度通常在幾百至幾千個(gè)核苷酸,因此使用隨機(jī)引物(RandomPrimerp(dN)6)即可隨機(jī)結(jié)合到mRNA的各位置進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。由于qPCR的過程只需擴(kuò)增目的片段的一部分(80~200bp),因此使用隨機(jī)引物的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物盡管不完整,也完全能夠滿足qPCR的需求。當(dāng)然,也可以使用OligodT引物統(tǒng)一從mRNA的ployA尾巴開始逆轉(zhuǎn)錄。這種逆轉(zhuǎn)錄引物在擴(kuò)增cDNA全長時(shí)是必須的,但要注意,原核生物的mRNA和某些lncRNA不具有ployA尾,因此不能使用OligodT引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)可以選擇加入RNA合成抑制劑RNAse防止RNA降解和污染。

反轉(zhuǎn)錄酶的用處:由它催化轉(zhuǎn)錄合成的DNA稱為互補(bǔ)DNA(cDNA)。通常情況下,細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)錄應(yīng)由DNA到RNA的,所得RNA為信使RNA(mRNA)供蛋白質(zhì)合成作模板用。而在部分RNA病毒中,要實(shí)現(xiàn)自身擴(kuò)增,必須具有DNA,因此先由RNA逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA再由cDNA轉(zhuǎn)錄出RNA。逆轉(zhuǎn)錄酶可用RT—PCR,將RNA轉(zhuǎn)變?yōu)镈NA后擴(kuò)增,以獲得RNA的序列。1970年從致死RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了反轉(zhuǎn)錄酶,并認(rèn)為此酶與病毒的致死性質(zhì)有關(guān)。反轉(zhuǎn)錄酶也分布于某些正常細(xì)胞和胚胎細(xì)胞。反轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)表明不能把生物的遺傳信息由DNA→mRNA→蛋白質(zhì)非常化,遺傳信息也可以從RNA傳遞到DNA。它促進(jìn)了分子生物學(xué)、生物化學(xué)和病毒學(xué)的研究,已成為研究這些學(xué)科的有力工具。逆轉(zhuǎn)錄PCR反應(yīng)過程中要注意反應(yīng)管中溶液面積不宜過高,避免泡沫問題。廣州cDNA合成逆轉(zhuǎn)錄酶

逆轉(zhuǎn)錄可用于新型病毒的檢測。無錫逆轉(zhuǎn)錄混合

逆轉(zhuǎn)錄過程是病毒的復(fù)制形式之一,如RNA病毒中的逆轉(zhuǎn)錄病毒,DNA病毒中的擬逆轉(zhuǎn)錄病毒的復(fù)制均需要經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄過程在真核細(xì)胞中也同樣存在,例如逆轉(zhuǎn)座子和端粒DNA的延長均存在逆轉(zhuǎn)錄過程,需逆轉(zhuǎn)錄酶的催化,端粒酶即為真核細(xì)胞中的逆轉(zhuǎn)錄酶。逆轉(zhuǎn)錄過程的揭示是分子生物學(xué)研究中的重大發(fā)現(xiàn),是對中心法則的重要修正和補(bǔ)充。人們通過體外模擬該過程,以樣本中提取的mRNA為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,合成出互補(bǔ)的cDNA,構(gòu)建cDNA文庫,并從中篩選特異的目的基因。該方法已成為基因工程技術(shù)中較常用的獲得目的基因的策略之一。無錫逆轉(zhuǎn)錄混合

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