miRNA逆轉錄莖環法:首先需要進行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設計。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會形成二聚體時才能用。取200ul的PCR管,根據所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應體系說明,依次向200μL的PCR管內加入下列試劑:加樣結束后,移液器吹打混勻,低速離心數秒。將逆轉錄PCR管放入PCR擴增儀內,調整參數:37℃15min(反轉錄反應),85℃5s(反轉錄酶的失活反應),4℃∞。反應結束后根據實驗需要進行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉錄引物,注意相應地調整無酶水的體積和反應溫度。逆轉錄過程中的缺陷會導致錯誤擴增和偏差。北京加尾法逆轉錄酶報價
逆轉錄的發現有重要的理論意義和實踐意義。(1)在致死病毒的研究中發現了病基因,在人類一些病細胞如膀胱病、小細胞肺病等細胞中,也分離出與病毒病基因相同的堿基序列,稱為細胞病基因或原病基因。病基因的發現為疙瘩發病機理的研究提供了很有前途的線索。(2)在實際工作中有助于基因工程的實施。由于目的基因的轉錄產物易于制備,可將mRNA反向轉錄形成DNA用以獲得目的基因。逆轉錄酶實驗操作注意事項:RNA提取一定要迅速,樣本要新鮮,組織盡量在液氮中研磨;RNA提取完馬上進行逆轉錄不要拖延,新提的RNA很容易降解;逆轉錄反應過程,需建立無RNAase環境,以避免模板RNA降解。RNase是RNA水解酶的統稱,包含RNaseA,RNaseH等,RNaseA可以水解單雙鏈RNA,RNaseH主要水解RNA與DNA雜交雙鏈中的RNA。北京加尾法逆轉錄酶報價逆轉錄現象說明:至少在某些生物中,RNA同樣兼有遺傳信息傳遞和表達功能。
莖環法逆轉錄是一種逆轉錄反應的技術,它利用莖環結構的RNA分子作為反向引物,在逆轉錄過程中特異性地擴增目標RNA分子。該技術在分子生物學和醫學研究中得到了普遍的應用,特別是在RNA的研究和檢測中具有獨特的優勢。莖環法逆轉錄技術的基本原理是利用逆轉錄酶和莖環結構的RNA作為反向引物,將RNA逆轉錄成cDNA,并在PCR反應中擴增。莖環結構的RNA分子具有較高的穩定性和特異性,可以特異性地識別和結合目標RNA分子,從而在逆轉錄反應中作為反向引物擴增目標cDNA。此外,由于莖環結構的RNA分子與目標RNA分子的堿基序列互補,因此莖環法逆轉錄技術可以避免隨機引物引起的非特異擴增。
逆轉錄實驗步驟:用SSⅢ逆轉錄酶進行RT(20ul體積)1、準備0、65ml的EP管。2、冰上操作:在EP管中加入10ulDEPC水,1ul引物,1ul模板RNA,1uldNTP,短暫離心。3、65℃水浴5分鐘后,立刻0℃冰水浴至少1分鐘。4、短暫離心后,冰上操作:加入4ul5×First-StrandBuffer,1ul0.1MDTT,1ulRNAseInhibitor,1ulSSⅢ逆轉錄酶。5、短暫離心。6、50℃水浴60分鐘進行逆轉錄。7、70℃水浴15分鐘滅活逆轉錄酶。8、-20℃保存,或立即進行PCR。MCERTmix含有比例優化的Oligo(dT)和RandomPrimers,使cDNA合成可從RNA轉錄本的各個區域起始,并具有相同的逆轉錄效率,較大程度保證qPCR結果的真實性和可重復性。逆轉錄是一種將RNA反轉錄為DNA的生物化學過程。
逆轉錄酶還有DNA內切酶活性,這可能與病毒基因整合到宿主細胞染色體DNA中有關。逆轉錄酶的發現對于遺傳工程技術起了很大的推動作用,它已成為一種重要的工具酶。用組織細胞提取mRNA并以它為模板,在逆轉錄酶的作用下,合成出互補的cDNA,由此可構建出cDNA文庫(cDNAlibrary),從中篩選特異的目的基因,這是在基因工程技術中較常用的獲得目的基因的方法。簡要過程表示:逆轉錄酶的作用是以dNTP為底物,以RNA為模板,tRNA(主要是色氨酸tRNA)為引物,在tRNA3'-末端上,按5'→3'方向,合成一條與RNA模板互補的cDNA單鏈,它與RNA模板形成RNA-cDNA雜交體。隨后又在反轉錄酶的作用下,水解掉RNA鏈,再以cDNA為模板合成第二條DNA鏈。至此,完成由RNA指導的DNA合成過程。病毒復制方式:逆轉錄病毒(屬于RNA病毒):RNA→DNA→RNA。擬逆轉錄病毒(屬于DNA病毒):DNA→RNA→DNA。逆轉錄實驗中可以通過qPCR檢測逆轉錄反應效果。上海miQP2反轉錄純度高
逆轉錄實驗在反應前應將各反應試劑混勻,避免試劑沉淀或剪切。北京加尾法逆轉錄酶報價
反轉錄酶的注意事項,引物的選擇,OligodT:選擇OligodT時,要求RNA必須有PolyA,所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT,所以對RNA樣品的質量要求較高,較好不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應,建議推薦使用OligodT引物。使用OligodT引物要比隨機引物和特異性引物的穩定性要好。特異性引物:特異性引物只能用你設計引物時的下游引物做RT,引物設計質量影響RT的結果,而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以按照說明書按照一個溫度做不是較佳選擇,一般不推薦。北京加尾法逆轉錄酶報價