2016年成功地將FMT應用于腸內急性GVHD中[4]，(類固醇抵抗，n=3；類固醇依賴，n=1)。發現接受FMT后，3例達到完全緩解，1例達到部分緩解。2018年蘇州大學附屬醫院團隊發表了一項前導性研究，將菌群移植用于胃腸道急性移植物抗宿主病中。該研究共納入8名類固醇難治性GI-GvHD患者,FMT后所有患者的臨床癥狀均得到改善，腸道菌群的多樣性及組成恢復正常，且無進展生存期延長。2020年8月《ScienceTranslationalMedicine》納入15名接受allo-HCT并發生腸道GvHD的患者，接受健康供體的單次菌群移植；在10名患者中，接受菌群移植1個月內可觀察到完全的臨床應答。且無需其它干預以緩解GvHD癥狀，其中6名可逐漸減少免疫抑制劑的使用；持續的GvHD緩解與患者的生存率提高相關。菌群移植不僅關乎醫治，更在于通過微生物調節，提升整體健康水平.湖北自閉癥腸道菌群移植

潰瘍性結腸炎（ulcerativecolitis，UC）是一種結腸處的慢性炎癥疾病，發病機理涉及多個因素，包括遺傳易感性、上皮屏障缺陷、免疫反應失調、環境因素等；潰瘍性結腸炎患者從直腸處開始發生粘膜炎癥，并持續擴散至近端結腸；潰瘍性結腸炎常表現出出血性腹瀉，可通過結腸鏡和組織檢查進行診斷；目前，全世界針對潰瘍性結腸炎沒有***藥物，一般只能用5-氨基水楊酸、皮質類固醇藥物以及一些***癥的單克隆抗體藥物來緩解癥狀。通過切除大腸可***潰瘍性結腸炎，但是將嚴重影響患者后續的生活質量，而且腸外癥狀無法通過大腸切除手術根除~湖南直腸菌群移植儀器菌群移植，又稱糞便移植，是一種將健康人的腸道菌群移植到患者腸道內的治療方法。

目前，針對菌群移植（FMT）標準化方法學的建立與臨床應用，初步達成13項標準和方法：（1）FMT診療服務與設施；（2）多學科診療團隊；（3）供體的篩選與管理流程；（4）菌液制備標準操作流程（standardoperationprocedure，SOP）；（5）腸道準備；（6）FMT實施時機；（7）患者入選與排除標準；（8）移植劑量；（9）移植療程和周期；（10）改善標準；（11）聯合用藥；（12）隨訪制度與隨訪平臺的建立；（13）不良反應的處理與預防。本共識依據的循證醫學證據質量和推薦強度按照GRADE推薦評價體系（GradingofRecommendationsAssessment）進行分級，證據質量分高、中、低和極低共4個級別，推薦強度分強烈推薦和一般性推薦共2個級別

菌群檢測的應用范圍十分普遍。首先，它可以幫助醫生診斷腸道疾病。比如，當患者出現腹瀉、炎癥性腸病等癥狀時，醫生可以通過菌群檢測了解腸道菌群的狀況，從而制定針對性的治療方案。其次，菌群檢測還能預測疾病的發展趨勢。比如，有研究發現，腸道菌群與肥胖、糖尿病、心血管疾病等慢性疾病的發展密切相關。通過對這些疾病的易感人群進行菌群檢測，科學家們可以預測患者未來患病的風險。菌群檢測還為科學健身提供了新思路。很多研究表明，運動可以影響腸道菌群的結構和功能，而腸道菌群又反過來影響人體的健康。通過菌群檢測，人們可以更好地了解自己的腸道健康狀況，從而制定更加適合自己的運動和飲食方案。未來，菌群移植有望成為多種疾病的重要手段之一。

現代菌群移植（FMT）和古代FMT之間存在明顯的方法學差異在于離心、冷凍保存和自動純化等方面。如何儲存糞菌仍然存在方法學上的挑戰。新鮮收集的糞便必須立即處理，不能存儲。冷凍的糞菌是用現代冷凍保存技術制備。有研究報道新鮮和凍存糞菌的臨床療效沒有統計學差異，但這一發現主要來自于一些關于CDI診療的試驗。在一項雙盲研究中，72名CDI患者腸鏡下隨機接受新鮮、冷凍或凍干的糞菌診療，改善率在接受新鮮糞菌組患者中比較高（25/25，100%），在凍干組中比較低（16/23，78%），冷凍組改善率處于兩者之間。冷凍的糞菌丟失了大量的細菌并且降低了其診療IBD的療效。這就是在我們推薦使用新鮮糞菌進行FMT診療的原因。在其他中心同樣觀察到新鮮糞菌的高臨床療效。因此，必要時臨床診療的選擇應考慮糞菌的保存方法。菌群移植并非適用于所有患者，醫生會根據具體情況進行評估和選擇。四川供體菌群移植耗材

在進行菌群移植前，需要對供體進行嚴格的篩選，確保其腸道菌群健康且無傳染性疾病。湖北自閉癥腸道菌群移植

2022年國家衛生健康委員會醫院管理研究所、中華醫學會腸外腸內營養學分會、中華醫學會腸外腸內營養學分會腸道微生態協作組發布《腸道菌群移植臨床應用管理中國共識(2022版)》，明確了FMT的適應癥，適應證:(1)消化系統疾病:包括艱難梭狀芽胞桿菌(CDI):復發性(難治性)CDI;其他消化系統疾病:潰瘍性結腸炎、克羅恩病、功能性、IBS、菌群紊亂相關腹瀉、肝硬化等。(2)腸道菌群紊亂所致的消化系統外疾病:腸道外疾病的適應證必須伴隨有胃腸道癥狀，或者當前研究證實該疾病與胃腸道癥狀或腸道菌群紊亂相關。①神經系統疾病:帕金森病、阿爾茨海默病(Alzheimer disease，AD)、肌萎縮側索硬化癥(amyotrophic lateral sclerosis，ALS)、癲癇等。②精神系統疾病:自閉癥、焦慮癥或抑郁癥、多動癥、抽動綜合征等。③代謝相關疾病:代謝綜合征、糖尿病、肥胖癥、脂肪肝、高脂血癥等。④tumor相關疾病:免疫的增敏、免疫及放化療所致腸炎等。⑤過敏性或免疫系統疾病:自身免疫性肝炎、系統性紅斑狼瘡、強制性脊柱炎、免疫性骨關節炎、過敏性皮炎、特發性血小板減少性紫癜等。⑥成人或兒童移植物抗宿主病(graft versus host disease，GVHD)。湖北自閉癥腸道菌群移植